苍蝇多以腐败有机物为食，因此常见于卫生较差的环境。苍蝇具有舐吮式口器，会污染食物，传播痢疾等疾病。

在生态系中，蝇的幼虫扮演动植物分解者的重要角色。苍蝇的成虫由于嗜食甜物质，因此也能代替蜜蜂用于农作物的授粉和品种改良。

临床医学上，活蝇蛆可接种于伤口之中，起杀菌清创，促进愈合之作用。

富含蛋白质的蝇蛆又是重要的饵料、饲料，可工厂化生产。